https://frosthead.com

Как ученые решают, какие геномы животных следует упорядочить

Что общего у африканских когтистых лягушек, орангутанов и коз? Генетики глубоко заглянули в свои гены: у этих видов секвенированы целые геномы.

Связанный контент

  • Что на самом деле в этом рулоне тунца? Тестирование ДНК может помочь вам узнать
  • Что значит быть видовым? Генетика меняет ответ
  • Это вымершие животные, которых мы можем и должны воскресить

Возможно, вы слышали о возможности секвенирования своего собственного генома. Несколько лет назад цена секвенирования генома человека упала до 1000 долларов. Это не карманные перемены, но и не те 2, 7 миллиарда долларов, которые стоило упорядочить первый человеческий геном. С животными все сложнее. Поскольку никакие другие виды этого вида никогда не были секвенированы, сложнее собрать геном без какой-либо ссылки.

Круглый червь C. elegans стал первым животным, у которого секвенировали геном в 1998 году. С тех пор усовершенствованная технология секвенирования генома позволила ученым перейти к значительно более сложным организмам и выполнять секвенирование намного быстрее и эффективнее.

Но все же маловероятно, что ученые когда-либо упорядочат геном каждого животного. Они должны выбирать. Так с чего начать?

Нет единого критерия, по которому принимается это решение. Иногда это делается для того, чтобы повысить осведомленность о видах и их потенциальной пользе для человечества: именно по этой причине исследователи из Национального университета Сингапура указали при подаче заявки на финансирование последовательности генома гадюки в храмовой яме в начале этого года, пишет Саманта Бо для Singapore Times . Гадюка - «единственный вид змей, который, как известно, вырабатывает токсин под названием ваглерин», - пишет она, - «нервно-мышечный ингибитор, который, как полагают ученые, может превратиться в миорелаксант».

Помимо потенциальных медицинских преимуществ секвенирования генома, эта практика важна для базового научного и исторического понимания мира. «В геномах живых видов заложены исторические следы адаптивных событий, которые привели их туда, где они находятся сегодня», - сказал Стивен О'Брайен, руководитель Лаборатории геномного разнообразия, на конференции.

Изучение нынешних геномов животных может рассказать ученым об их прошлом как виде - и об истории среды, в которой они жили, и других видов, которые жили с ними. Например, геномы одомашненных животных могут помочь объяснить прошлое человечества. Люди и животные, такие как коровы и свиньи, были изменены (и продолжают меняться), когда часть человечества успокоилась и начала заниматься сельским хозяйством. Изучение того, как они эволюционировали, когда стали одомашненными, помогает генетикам понять факторы древней эволюции человека и может помочь объяснить, когда именно животные были одомашнены.

Геномы этих домашних животных также могут многое предложить человечеству. «Точные эталонные геномы важны для понимания биологии организма, для изучения генетических причин здоровья и болезней и, для животных, для принятия решений о разведении», - говорится в пресс-релизе Национального исследовательского института генома человека.

Иногда секвенирование генома животного помогает ученым сохранять остроту. Канадские исследователи, которые обычно работают над геномом человека, секвенировали геном бобра в начале этого года на праздновании 150-летия Канады. «Большинство наших усилий сосредоточено на геномах человека», - сказал мне ученый Стивен Шерер. «Но на самом деле это стимулирует нас интеллектуально смотреть за пределы того, что мы делаем». Не повредило, что бобр является национальным символом Канады. Потому что иногда хорошие общественные отношения так же хороши, как и любая другая.

papadum_goat.jpg Пападум, козел Сан-Клементе, чей геном был реконструирован с использованием новой техники в начале этого года. (Брайан Л. Сайр)
Как ученые решают, какие геномы животных следует упорядочить