Нет сомнений, что микроскопические водные беспозвоночные, известные как tardigrades, моховые поросята или водяные медведи, странные. Странно очаровательные твари могут выжить в космическом вакууме, перенести высыхание в результате засухи и появиться живыми после замерзания, среди прочих подвигов. Недавнее исследование показывает, что tardigrades также являются украденными генами - что их геномы содержат больше ДНК от неродственных растений, бактерий и других микробов, чем от любого другого животного на Земле, недавно сообщила Рэйчел Нувер для Smithsonian.com . Эта способность может даже объяснить, почему tardigrades настолько устойчивы, предполагают исследователи.
Но примерно через неделю после объявления об этом удивительном открытии другая группа оспорила результаты, сообщает Эд Йонг для The Atlantic . Быстрое движение вперед и назад между двумя командами демонстрирует, насколько отзывчивой и потенциально самокорректирующейся наукой может быть цифровая эпоха.
Первое исследование, проведенное командой из Университета Северной Каролины, показало, что один вид tardigrade несет колоссальные 6600 генов, которые первоначально принадлежали организмам из других королевств - в основном бактерии, а также грибы, растения, вирусы и археи, и приобретенные через Процесс называется горизонтальной передачей генов. Эти результаты означают, что геном Hypsibius dujardini состоит из примерно 17, 5% чужеродной ДНК, сообщается в журнале «Труды Национальной академии наук» . Поскольку некоторые из чужеродных генов участвуют в стрессовых реакциях других организмов, исследователи подозревают, что они могли дарить tardigrades с некоторыми из их собственных уникальных способностей выдерживать экстремальные условия.
Тем не менее, вторая группа из Университета Эдинбурга также секвенировала те же виды tardigrade и получила очень разные результаты. Эти исследователи обнаружили, что у твари есть от 36 до 500 горизонтально переносимых генов - гораздо меньший процент. Когда вышла статья UNC, результаты в Эдинбурге все еще не были опубликованы, но исследователи изо всех сил пытались опубликовать свои результаты на сервере препринтов bioRxiv.org - веб-сайте, где рукописи могут публиковаться до их отправки в журнал, и рецензирование, типичное для научное исследование.
Эдинбургская группа подозревает, что группа UNC, возможно, имела «секвенированную ДНК из бактерий, которые жили вместе с тардиградами, и, несмотря на все их усилия, ошибочно приняли гены этих микробов за настоящие гены тардиграда», - пишет Йонг. Но как могла первая группа ошибиться, если это действительно так? Йонг объясняет, что технология для секвенирования геномов включает в себя измельчение ДНК на мелкие кусочки, а затем сборку фрагментов в последовательную картину. Некоторое загрязнение может легко проникнуть, поэтому ученые пытаются выяснить, какие частицы принадлежат организму, который они изучают, а не микробам поблизости.
Эдинбургская группа поняла, что некоторые фрагменты ДНК были редки по сравнению с другими фрагментами. «С биологической точки зрения, это никак не может быть частью одного и того же генома», - говорит лидер команды Марк Блэкстер. Группа пришла к выводу, что в геноме tardigrade 500 генов, которые могли быть получены из других источников, но у них есть только веские доказательства в отношении 36 из них. Это дает tardigrade гораздо более типичную пропорцию чужеродной ДНК для животного.
В комментарии к новейшей статье Томас Бутби и Боб Гольдштейн из UNC отмечают, что они знали об этой потенциальной проблеме и усердно работали над тем, чтобы она не повлияла на их результаты, но что всегда есть вероятность ошибки. Они добавляют, что проведут дополнительный анализ, прежде чем делать дальнейшие комментарии. Исследователи также сказали, что они высоко оценили решение своих конкурентов так быстро опубликовать свои противоречивые результаты на bioRxiv.org .
Чувства были взаимными. Суджай Кумар из эдинбургской команды сказал Йонгу, что если бы группа UNC не выпустила свои данные быстро, это было бы более сложным для их группы. «Что очевидно, так это удивительная новая способность науки быстро исправлять себя», - рассказывает Блекстер. То, что в этом случае заняло всего девять дней, заняло бы месяцы в прошлом.
В настоящее время жюри до сих пор не знает, какая часть генома tardigrade поступает из зарубежных источников. Но даже если эти крошечные существа не гены-похитители, они могут быть хедлайтерами заголовков на некоторое время.
Примечание редактора: эта статья была отредактирована Рэйчел Нувер, которая первоначально сообщила об исследовании tardigrade для Smithsonian.com.
