Это звучит как аргумент, который могут возникнуть у ученых во время ночи питья: у какого существа самый интересный геном в мире? Но вопрос не просто мимолетный.
Биотехнологическая компания Сан-Франциско Pacific Biosciences провела открытый конкурс, чтобы определить, кто из них должен получить эту честь. Победитель: Сэнди Малики, чистокровный австралийский динго из пустыни. Теперь компания создаст последовательность генома динго, чтобы помочь исследователям изучить процесс одомашнивания.
Сэнди победил четырех других интересных финалистов в конкурсе, получив 41 процент публичных голосов, которые были поданы со всего мира. Уже четвертый год компания выступает спонсором конкурса. Компания приглашает исследователей присылать заявки на гранты, объясняющие, почему интересные растения и животные, которых они изучают, должны быть упорядочены. Затем комитет ученых сокращает количество участников до пяти финалистов для окончательного публичного голосования.
В этом году финалисты включили взрывного бомбардировщика, который при нападении испускает кипящий взрывоопасный газ; розовый голубь, находящийся под угрозой исчезновения родственник вымершего додо; морской слизень, который крадет хлоропласты у водорослей и гадюки из ямы храма, чей яд может иметь лекарственную ценность.
В то время как Ретт Джонс из Gizmodo утверждает, что динго победил, потому что это мило - а интернет любит мило - исследователи из Университета Нового Южного Уэльса, которые составили предложение, считают, что его геном также имеет научную ценность.
Билл Баллард из UNSW сообщает Ким Арлингтону из The Sydney Morning Herald, что Дарвин полагал, что одомашнивание - это двухэтапный процесс. Первым шагом является естественный процесс, называемый бессознательным отбором, который приводит к признакам у животного, которые могут сделать его пригодным для одомашнивания. Вторым этапом является искусственный отбор, при котором люди избирательно разводят этих животных для усиления или уменьшения специфических признаков.
Сэнди - один из трех щенков дикого пустынного динго, найденных заброшенными в пустыне в центральной Австралии в 2014 году. Чистокровные динго редки из-за широко распространенного скрещивания с домашними собаками. Таким образом, Сэнди может научить исследователей бессознательному отбору и тому, какие природные особенности делают диких собак пригодными для одомашнивания.
Многие люди не знают о динго. Не ясно, являются ли они типом домашней собаки или отличным видом. Также неизвестно, как они попали в Land Down Under. Но поскольку коренные австралийцы не одомашнили динго, чистокровные животные практически не изменились с момента их прибытия.
«Сэнди - настоящий подарок науке», - говорит Баллард в пресс-релизе. «[S] выравнивание генома Сэнди поможет определить некоторые гены по темпераменту и поведению, которые лежат в основе перехода от диких животных к идеальным домашним животным».
Баллард также говорит, что существует аспект сохранения последовательности генома, поскольку это позволит исследователям улучшить тесты для определения генетической чистоты динго.
Секвенирование генов будет проводиться в Университете Аризоны с использованием метода секвенирования PacBio Single Molecule, Real-Time (SMRT), который позволяет секвенировать намного более длинные участки ДНК за один раз по сравнению с другими методами. Затем данные будут проанализированы немецкой компанией Computomics.
В прошлом году этот вид растений, извлекающих тяжелые металлы из почвы, победил в конкурсе.
